现在农业种植生产中，如果还在使用鸡粪、猪粪、牛粪等人工养殖动物的新鲜粪便作为有机肥的，特别是不经过发酵堆沤处理而直接施用的话，这样的做法是是十分危险的，将对种植业产生极大的危害。
鸡、牛、猪等人工养殖动物的畜禽粪便，在农民眼中是劲头儿十足的有机肥，实际上却是避之不及的有害物质。在过去，一家一户小规模散养时确实是“肥粪一家”，但现在规模养殖场已经成为畜禽养殖的主流，饲料添加剂大量使用甚至超量使用，如果把未经处理的畜禽粪便直接当作肥料，不但种出的不是有机作物，还会给作物、土地带来意想不到的危害。
就拿鸡粪来说，在所有禽畜粪便中养分最高、最全面，是有机肥生产的理想原材料，但如果未经充分发酵或腐熟而直接施用到作物上，则存在几大害处：
1、鸡粪中含有大肠杆菌、线虫等病菌和害虫，未经发酵或腐熟处理直接使用会传播病虫害，导致作物发病，对食用农产品的人体健康也产生影响；
2、直接施用鸡粪时，发酵产生的热量和多种气体，造成作物烧根、烧苗，并使土壤缺氧；
3、鸡粪是酸性肥料（pH值为3.6～4.7），在果园里施用酸性鸡粪无形中增加了土壤的酸碱度；
4、重金属超标，鸡粪中含有高含量的铜、汞、铬、镉、铅、砷等重金属，还有较多的抗生素和激素残留，会造成农产品重金属超标，给食品安全埋下隐患。
所以，要安全、合理地施用鸡粪，就必须经过充分的发酵腐熟以灭杀大肠杆菌、线虫，专业化处理降低重金属含量，来保证种植植物的安全。
实际上，在目前农业生产来说，我们可以选择一些秸秆、一些粮食下脚料，或者一些油类、豆粕类、花生粕类含有植物蛋白的这类原料生产有机肥。这种有机肥经过高温和无害化处理，本身就有很强的螯合作用，进入到土壤中以后，能够养活大量的微生物，而且可以直接供给作物营养吸收。同时，这些有机质是多种复合酸组成，可以螯合土壤中的大量元素，使用这种有机肥，可以解决土壤微环境问题，也能满足作物地上部生长的生理需求，并且能够持续改良土壤，生产出优质农产品，保证我们的食品安全，建立一个安全和谐的生活环境。